Les magical girls, chargées d'exterminer de dangereuses créatures appelées "Kaii", sont adulées de tous. Kana Sakuragi, étudiante à la recherche d'un emploi, commence à désespérer, quand elle se retrouve impliquée dans une attaque de Kaii. Hitomi Koshigaya, magical girl, vole à sa rescousse, mais elle doit faire face à un ennemi plus redoutable que prévu. Kana lui propose alors son aide…

Après avoir aidé Koshigaya, Kana décide de rejoindre Magilumière Co. Ltd. Elle y rencontre le président Kouji Shigemoto, l'ingénieur Kazuo Nikoyama et Kaede Midorikawa, des ventes, tous hauts en couleurs. Elle commence à regretter d'avoir rejoint l'entreprise aussi vite, mais Midorikawa l'encourage à se former à la conduite du BALAI. C'est alors qu'on leur demande d'exterminer un Kaii...

Un mois après que Kana ait rejoint Magilumière Co. Ltd., elle et Hitomi Koshigaya se font sucrer leur proie en pleine mission par Mei Tsuchiba, une magical girl concurrente. Plus tard, une demande d'extermination amène l'équipe à discuter de solutions. Kana est étonnée que Shigemoto critique son idée, qui ne correspond pas à l'esthétique de l'entreprise. Et l'activité des Kaii s'intensifie...

Pour protéger un quartier commerçant historique, Kana propose d'utiliser un nouveau type de magie. Shigemoto donne le feu vert et l'ingénieur en magie Nikoyama entre en action pour donner vie à sa théorie. Sur place, Kana et Koshigaya se séparent pour s'occuper de leurs ennemis. Alors que le combat fait rage, la magie originale de Magilumiere est enfin prête à être utilisée !

Sur ordre de Shigemoto, l'équipe de Magilumière part au karaoké. À part Midorikawa, tout le monde chante et se dévoile derrière le micro. Un véritable succès ! Le lendemain, Shigemoto reçoit un coup de fil de Miyako Asou, une vieille amie et présidente de Miyakodo, un important fabricant de cosmétiques. Kana se voit confier une semaine de travail au sein de leur département magical girls.

Sur ordre de Shigemoto, l'équipe de Magilumière part au karaoké. À part Midorikawa, tout le monde chante et se dévoile derrière le micro. Un véritable succès ! Le lendemain, Shigemoto reçoit un coup de fil de Miyako Asou, une vieille amie et présidente de Miyakodo, un important fabricant de cosmétiques. Kana se voit confier une semaine de travail au sein de leur département magical girls.

Kana et Lily sont dans une situation délicate lorsqu'un Kaii mutant les attaque. Mei, d'AST Corporation, leur vient en aide. Sur ses ordres, Kana et Lily partent évacuer les passants, et Mei commence à se battre seule contre le Kaii. Un combat acharné s'engage. Inquiète pour elle, Kana retourne sur les lieux. Trouvant une Mei blessée et mal en point, Kana lui propose de se battre à ses côtés…

Bienvenue à l'EXPO annuelle des technologies magiques ! À l'exposition, Nikoyama n'a pas la langue dans sa poche lorsque l'équipe est approchée par de célèbres ingénieurs en magie. La magie qu'il a créée pour secourir le quartier commerçant fait parler d'elle ! Alors qu'ils assistent à une démonstration de magie sur la gestion des Kaii mutants, l'un d'entre eux apparaît sur les lieux !

Il y a trois ans, Nikoyama, alors étudiant, était passionné de créations magiques. Malgré son talent, sa peur de la critique l'a empêché de travailler dans le milieu. C'est alors qu'il a reçu un appel ! À l'EXPO des technologies magiques, Nikoyama développe une magie pour lutter contre le Kaii mutant, mais son PC fait des siennes. Il demande alors de l'aide aux ingénieurs qui l'entourent...

Kana et Koshigaya rendent visite à Hana Ginji, la créatrice des BALAIs utilisés par Magilumière. Cette dernière leur apprend qu'elle travaille sur un nouveau modèle ! Pendant ce temps, Magilumière fait la une après la publication d'une vidéo de leur intervention à l'EXPO. Shigemoto souhaite l'utiliser pour développer ses activités et vendre la technologie de Magilumière à d'autres entreprises.

Kana est chargée de former Akane Makino, une magical girl affectée à Magilumiere depuis Apda. Au départ, Akane se montre très insistante, ce qui surprend Kana. En réalisant à quel point Akane est sérieuse, le fossé qui les sépare se comble peu à peu. Lorsque Kana, Koshigaya et Akane sont envoyées sur une mission, Kana ne doit pas asssiter Koshigaya, mais soutenir sa stagiaire...

Dans l'immeuble où se trouvent Kana et Akane, un immense Kaii mutant les entoure de flammes. Shigemoto et les autres tentent de trouver une solution, mais ils manquent de données… Kana et Akane tentent de rejoindre Koshigaya, mais les flammes les encerclent. Kana se souvient alors des paroles de Shigemoto, et elle rassemble tout le monde pour affronter à nouveau les Kaii !